法律分析：外资公司股权转让协议的签署流程如下:1、转让方和受让方之间达成合意;2、签订股权转让协议;3、公司注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并修改公司章程和股东名册等等;4、在三十日内申请变更登记。
法律依据：《中华人民共和国公司法》 第七十三条 依照本法第七十一条、第七十二条转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。对公司竟程的该项修改不需再由股东会表决。